Sasahara ne regrette pas d'être rentré au club Genshiken. Il vit cette expérience avec plaisir jusqu'au jour où l'université décide de le fermer, ainsi que d'autres clubs, en raison de leur manque d'activités officielles. Atterrés par cette cruelle nouvelle, les membres baissent les bras. Mais à la surprise générale, Saki refuse ce coup du destin et s'engage dans un combat pour sauver le club.