Alors que le combat d'Alucard contre Tobalkain touche à sa fin, les véritables intentions des adversaires de la fondation Hellsing se profilent enfin. L'Ultime bataillon, relique du IIIe Reich, projette de fonder une armée entièrement composée d'êtres surnaturels afin de propager la guerre et la désolation sur la surface de la planète. Pour cela, ils comptent bien détruire la fondation Hellsing.